Bug #857: RCP: 0.7.6, the check and update R packages command hangs under operating systems using proxy connection - Plateforme TXM - Forge du Centre Blaise Pascal

Bug #857

RCP: 0.7.6, the check and update R packages command hangs under operating systems using proxy connection

Ajouté par Sebastien Jacquot il y a plus de 11 ans. Mis à jour il y a plus d'un an.

Statut:

New

Début:

12/06/2014

Priorité:

Low

Echéance:

Assigné à:

% réalisé:

50%

Catégorie:

Network

Temps passé:

Version cible:

TXM 0.X.X

Description

The check and update R packages command hangs under operating systems using proxy connection.
TXM commands using R functions are not available after hanging.
We may need to start R with this argument: --internet2,
using native operating system configuration, or implement a time out.

We now fully manage the proxy configuration, see #868

Validation tests¶

Devs must update a package on cran, e.g. : "textometry"

run TXM on a proxy system
call the "File\Check R packages" command
=> console output must be:

TBD

Demandes liées

Historique

#1 Mis à jour par Matthieu Decorde il y a plus de 11 ans

Description mis à jour (diff)

#2 Mis à jour par Serge Heiden il y a plus de 11 ans

Sujet changé de RCP: 0.7.6, the check and update R packages command hangs under OS using proxy connection à RCP: 0.7.6, the check and update R packages command hangs under Mac OS X using proxy connection
Description mis à jour (diff)

#3 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a environ 11 ans

Sujet changé de RCP: 0.7.6, the check and update R packages command hangs under Mac OS X using proxy connection à RCP: 0.7.6, the check and update R packages command hangs under operating systems using proxy connection
Description mis à jour (diff)

Tested on Mac OS X and Windows XP.

#4 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a environ 11 ans

Win XP:
- there's already a time out, after waiting 32 minutes here is the log:

Update of 'textometry' failed (current version is still 0.1.1). Warning: Windows users need to restart TXM.

- then TXM works normally

#5 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a environ 11 ans

Temporary workaround to interrupt the package updating on Windows under proxy:
- start TXM
- when following message appears: "Updating the textometry (0.1.1) R package up to version 0.1.3"
- run the task manager and kill the "Rserve.exe" process
- in TXM execute "File\Restart engines"
- TXM should work normally

#6 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a environ 11 ans

The "check R packages" command is no longer executed at TXM start up.

#7 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a presque 11 ans

Catégorie changé de Stats / R à Network

#8 Mis à jour par Matthieu Decorde il y a presque 11 ans

Tâche parente mis à #1022

#9 Mis à jour par Matthieu Decorde il y a presque 11 ans

% réalisé changé de 0 à 60

Linux and Windows test passed

#10 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a plus de 10 ans

Statut changé de New à Closed
% réalisé changé de 60 à 100

Closed for redundancy, see #868.

#11 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a plus de 10 ans

Statut changé de Closed à New
Priorité changé de High à Low
Version cible changé de TXM 0.7.7 à TXM 0.7.8
% réalisé changé de 100 à 50

After some new tests, this command hangs up TXM on proxy system but with no proxy configured in RCP preferences.
In this case, the R time out connection is used. Is there anyway to reduce the time out connection in R ?
And/or better, execute this command in a non blocking thread ?

#12 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a plus de 10 ans

[WIP]

We now give the system proxy settings to R/RServe, see #868.
We still need to validate the packages updating functionality on proxy systems.

install.packages("textometry", dependencies=TRUE, repos="http://cran.rstudio.com/");

in an .R session file seems to work well now, therefore "check R packages" should use this type of command (I mean without precising the method: curl, wget, etc.). I don't know the current method used for this command.