Task #2955

Task #2845: Setup, Ubuntu 20.04, prepare TXM 0.8.1 to be fully compatible with Ubuntu 20.04 debian packages

Prepare R and libraries for Ubuntu 20.04

Ajouté par Matthieu Decorde il y a presque 5 ans. Mis à jour il y a plus d'un an.

Statut:Closed Début:27/11/2020
Priorité:High Echéance:
Assigné à:- % réalisé:

100%
Catégorie:Stats / R Temps passé: -
Version cible:TXM 0.8.2

Description

Known problems :
  • some libs (used by R or its packages) are no more available in the Debian packages :
    • libpng12
    • libgfortran
      • gcc-6-base

Diagnose

Run TXM's R via terminal: 

cd /usr/lib/TXM-0.8.1/plugins/org.txm.statsengine.r.core.linux_1.0.0.*/res/linux64/bin
./R

Solution 1

Ubuntu 20.04: ship the missing libraries in TXM R lib directory : /usr/lib/TXM-0.8.1/plugins/org.txm.statsengine.r.core.linux_1.0.0.*/res/linux64/lib

Ubuntu 16.04:
  • this new libs will broke the dependancies -> remove the libpng12 and libgfortran files of the lib directory
  • if installed with the deb installer remove /usr/lib/TXM-0.8.1/plugins/org.txm.statsengine.r.core.linux_1.0.0.*/res/linux64/lib/libgfortran.so.3
  • if installed with an update remove ~/.TXM-0.8.1/plugins/org.txm.statsengine.r.core.linux_1.0.0.*/res/linux64/lib/libgfortran.so.3

Demandes liées

lié à Task #3086: R, update to last stable version New 27/11/2020

Historique

#1 Mis à jour par Matthieu Decorde il y a plus de 4 ans

  • Description mis à jour (diff)

#2 Mis à jour par Matthieu Decorde il y a plus de 4 ans

  • Description mis à jour (diff)

#3 Mis à jour par Matthieu Decorde il y a plus de 4 ans

  • Description mis à jour (diff)

#4 Mis à jour par Matthieu Decorde il y a plus de 4 ans

  • Description mis à jour (diff)

#5 Mis à jour par Alexey Lavrentev il y a plus de 4 ans

I tried the solution 1 (ubuntu 16.04) :

No libfortran found in /usr/lib/TXM-0.8.1/plugins/org.txm.statsengine.r.core.linux_1.0.0.202006290905/res/linux64/lib

libpng12.so.0 removed.

The specificity and CA still don't work, with the same errors :

impossible de trouver la fonction "phyper" for Specificities
** Erreur R : "Error : le chargement du package ou de l'espace de noms a échoué pour ‘FactoMineR’" for CA

#6 Mis à jour par Matthieu Decorde il y a plus de 4 ans

  • Description mis à jour (diff)

#7 Mis à jour par Matthieu Decorde il y a plus de 4 ans

  • Description mis à jour (diff)
  • % réalisé changé de 0 à 80

Ubuntu 16.04 support stopped stopped

#8 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a plus d'un an

  • % réalisé changé de 80 à 100

#9 Mis à jour par Sebastien Jacquot il y a plus d'un an

  • Statut changé de New à Closed

Formats disponibles : Atom PDF