/examples/Vasp/Serial/Test_Vasp_Serial.path - Annoter - OpenPath - Forge du Centre Blaise Pascal

1

equemene

 &path

2

1

equemene

  nat=23,  ! Number of atoms

3

1

equemene

  ngeomi=2,! Number of initial geometries

4

1

equemene

  ngeomf=10, !Number of geometries along the path

5

1

equemene

  OptReac=F, ! Do you want to optimize the reactants ?

6

1

equemene

  OptProd=F, ! Don't optimize the products

7

1

equemene

  EProd= -139.258087, ! As we don't optimize products, we can give their energy

8

1

equemene

  EReac= -139.578314,! Energy of the reactant, because it is not calculated

9

1

equemene

  PathOnly=F,  ! do NOT stop after generating the first path

10

1

equemene

  Fcart=T,  ! Some atoms  described in cartesian coordinates. See CartList.

11

1

equemene

  AtTypes="Pt" "C" "O" ,! Type of the atoms

12

1

equemene

  coord='mixed', !  ! we use mixed coordinates

13

1

equemene

  maxcyc=30,! Launch 30 iterations

14

1

equemene

  IReparam=1,! re-distribution of points along the path every 1 iteration

15

1

equemene

  SMax=0.1, ! Max displacement will be 0.1 a.u.

16

1

equemene

  ISpline=5, ! Start using spline interpolation at iteration

17

1

equemene

  prog='VaSP',! we use the VASP program to get energy and gradients

18

1

equemene

  RunMode='Serial',  ! we compute E and Forces  sequentially

19

1

equemene

  progexe='./RunVasp' ! we use the scrip RunVasp to actually launch VASP

20

1

equemene

21

1

equemene

 &CartList List=1 -20 /

22

1

equemene

Pt(111) 5c met. 6 c vides + (2x2) + CO+O

23

1

equemene

   1.00000000000000

24

1

equemene

     5.6241399999999997    0.0000000000000000    0.0000000000000000

25

1

equemene

    -2.8120699999999998    4.8706481144402121    0.0000000000000000

26

1

equemene

     0.0000000000000000    0.0000000000000000   22.9993025279694656

27

1

equemene

  20   1   2

28

1

equemene

Selective dynamics

29

1

equemene

Direct

30

1

equemene

  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F

31

1

equemene

  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F

32

1

equemene

  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F

33

1

equemene

  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F

34

1

equemene

  0.1666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F

35

1

equemene

  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F

36

1

equemene

  0.1666666666666643  0.8333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F

37

1

equemene

  0.6666666666666643  0.8333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F

38

1

equemene

  0.3312494678895713  0.1656247339447821  0.2000650221512907   T   T   T

39

1

equemene

  0.8343752660552178  0.1656247339447821  0.2000650221512907   T   T   T

40

1

equemene

  0.8343752660552178  0.6687505321104290  0.2000650221512907   T   T   T

41

1

equemene

  0.3333333333333357  0.6666666666666643  0.1989322786478102   T   T   T

42

1

equemene

  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.3049797611957177   T   T   T

43

1

equemene

  0.5012215770853086  0.0024431541706242  0.2988640527255405   T   T   T

44

1

equemene

  0.9975568458293755  0.4987784229146913  0.2988640527255405   T   T   T

45

1

equemene

  0.5012215770853086  0.4987784229146913  0.2988640527255405   T   T   T

46

1

equemene

  0.1636261803593769  0.3272523607187537  0.4016023552577619   T   T   T

47

1

equemene

  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.4039432223561479   T   T   T

48

1

equemene

  0.1636261803593769  0.8363738196406233  0.4016023552577619   T   T   T

49

1

equemene

  0.6727476392812467  0.8363738196406233  0.4016023552577619   T   T   T

50

1

equemene

  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.4851233567089529   T   T   T

51

1

equemene

  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.5353693274205206   T   T   T

52

1

equemene

  0.3333333333333286  0.6666666666666714  0.4552485250372680   T   T   T

53

1

equemene

Pt(111) 5c met. 6 c vides + (2x2) + CO+O

54

1

equemene

   1.00000000000000

55

1

equemene

     5.6241399999999997    0.0000000000000000    0.0000000000000000

56

1

equemene

    -2.8120699999999998    4.8706481144402121    0.0000000000000000

57

1

equemene

     0.0000000000000000    0.0000000000000000   22.9993025279694656

58

1

equemene

  20   1   2

59

1

equemene

Selective dynamics

60

1

equemene

Direct

61

1

equemene

  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F

62

1

equemene

  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F

63

1

equemene

  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F

64

1

equemene

  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F

65

1

equemene

  0.1666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F

66

1

equemene

  0.6666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F

67

1

equemene

  0.1666666666666643  0.8333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F

68

1

equemene

  0.6666666666666643  0.8333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F

69

1

equemene

  0.3333353975168575  0.1666438715374017  0.1986002597140218   T   T   T

70

1

equemene

  0.8333403210548475  0.1666509691792946  0.1985951454848725   T   T   T

71

1

equemene

  0.8333409037841187  0.6666472796414442  0.1985964980703305   T   T   T

72

1

equemene

  0.3333238335130192  0.6666392268365445  0.1985886239182766   T   T   T

73

1

equemene

  0.9999617034511911  0.9998888282191930  0.2974795871350692   T   T   T

74

1

equemene

  0.4999473247002513  0.9998693862713626  0.2974682028687743   T   T   T

75

1

equemene

  0.9999863206811004  0.4999301882185511  0.2974642227650535   T   T   T

76

1

equemene

  0.4999658150793101  0.4999168754294835  0.2974680428614041   T   T   T

77

1

equemene

  0.1665405010219072  0.3330823961827170  0.3974964450182662   T   T   T

78

1

equemene

  0.6665975225309845  0.3330642960797304  0.3975177029878819   T   T   T

79

1

equemene

  0.1665996677662783  0.8330538544691352  0.3975167863229472   T   T   T

80

1

equemene

  0.6665572450291234  0.8331019445865336  0.3974969275775631   T   T   T

81

1

equemene

  0.5929747344527317  0.4140358994090573  0.5812350180389987   T   T   T

82

1

equemene

  0.6943114107032239  0.2794239342435746  0.5915072062646071   T   T   T

83

1

equemene

  0.4917024505660316  0.5487034897377517  0.5709635073040794   T   T   T

Chimie Théorique » OpenPath

root / examples / Vasp / Serial / Test_Vasp_Serial.path @ 1

-equemene
+ &path
-equemene
+  nat=23,  ! Number of atoms
-equemene
+  ngeomi=2,! Number of initial geometries
-equemene
+  ngeomf=10, !Number of geometries along the path
-equemene
+  OptReac=F, ! Do you want to optimize the reactants ?
-equemene
+  OptProd=F, ! Don't optimize the products
-equemene
+  EProd= -139.258087, ! As we don't optimize products, we can give their energy
-equemene
+  EReac= -139.578314,! Energy of the reactant, because it is not calculated
-equemene
+  PathOnly=F,  ! do NOT stop after generating the first path
-equemene
+  Fcart=T,  ! Some atoms  described in cartesian coordinates. See CartList.
-equemene
+  AtTypes="Pt" "C" "O" ,! Type of the atoms
-equemene
+  coord='mixed', !  ! we use mixed coordinates
-equemene
+  maxcyc=30,! Launch 30 iterations
-equemene
+  IReparam=1,! re-distribution of points along the path every 1 iteration
-equemene
+  SMax=0.1, ! Max displacement will be 0.1 a.u.
-equemene
+  ISpline=5, ! Start using spline interpolation at iteration
-equemene
+  prog='VaSP',! we use the VASP program to get energy and gradients
-equemene
+  RunMode='Serial',  ! we compute E and Forces  sequentially
-equemene
+  progexe='./RunVasp' ! we use the scrip RunVasp to actually launch VASP
 equemene
-equemene
+ &CartList List=1 -20 /
-equemene
+Pt(111) 5c met. 6 c vides + (2x2) + CO+O
-equemene
+.00000000000000
-equemene
+.6241399999999997    0.0000000000000000    0.0000000000000000
-equemene
+    -2.8120699999999998    4.8706481144402121    0.0000000000000000
-equemene
+.0000000000000000    0.0000000000000000   22.9993025279694656
-equemene
+1   2
-equemene
+Selective dynamics
-equemene
+Direct
-equemene
+.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
-equemene
+.5000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
-equemene
+.0000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
-equemene
+.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
-equemene
+.1666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
-equemene
+.6666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
-equemene
+.1666666666666643  0.8333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
-equemene
+.6666666666666643  0.8333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
-equemene
+.3312494678895713  0.1656247339447821  0.2000650221512907   T   T   T
-equemene
+.8343752660552178  0.1656247339447821  0.2000650221512907   T   T   T
-equemene
+.8343752660552178  0.6687505321104290  0.2000650221512907   T   T   T
-equemene
+.3333333333333357  0.6666666666666643  0.1989322786478102   T   T   T
-equemene
+.0000000000000000  0.0000000000000000  0.3049797611957177   T   T   T
-equemene
+.5012215770853086  0.0024431541706242  0.2988640527255405   T   T   T
-equemene
+.9975568458293755  0.4987784229146913  0.2988640527255405   T   T   T
-equemene
+.5012215770853086  0.4987784229146913  0.2988640527255405   T   T   T
-equemene
+.1636261803593769  0.3272523607187537  0.4016023552577619   T   T   T
-equemene
+.6666666666666643  0.3333333333333357  0.4039432223561479   T   T   T
-equemene
+.1636261803593769  0.8363738196406233  0.4016023552577619   T   T   T
-equemene
+.6727476392812467  0.8363738196406233  0.4016023552577619   T   T   T
-equemene
+.6666666666666643  0.3333333333333357  0.4851233567089529   T   T   T
-equemene
+.6666666666666643  0.3333333333333357  0.5353693274205206   T   T   T
-equemene
+.3333333333333286  0.6666666666666714  0.4552485250372680   T   T   T
-equemene
+Pt(111) 5c met. 6 c vides + (2x2) + CO+O
-equemene
+.00000000000000
-equemene
+.6241399999999997    0.0000000000000000    0.0000000000000000
-equemene
+    -2.8120699999999998    4.8706481144402121    0.0000000000000000
-equemene
+.0000000000000000    0.0000000000000000   22.9993025279694656
-equemene
+1   2
-equemene
+Selective dynamics
-equemene
+Direct
-equemene
+.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
-equemene
+.5000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
-equemene
+.0000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
-equemene
+.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000   F   F   F
-equemene
+.1666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
-equemene
+.6666666666666643  0.3333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
-equemene
+.1666666666666643  0.8333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
-equemene
+.6666666666666643  0.8333333333333357  0.1000000000000014   F   F   F
-equemene
+.3333353975168575  0.1666438715374017  0.1986002597140218   T   T   T
-equemene
+.8333403210548475  0.1666509691792946  0.1985951454848725   T   T   T
-equemene
+.8333409037841187  0.6666472796414442  0.1985964980703305   T   T   T
-equemene
+.3333238335130192  0.6666392268365445  0.1985886239182766   T   T   T
-equemene
+.9999617034511911  0.9998888282191930  0.2974795871350692   T   T   T
-equemene
+.4999473247002513  0.9998693862713626  0.2974682028687743   T   T   T
-equemene
+.9999863206811004  0.4999301882185511  0.2974642227650535   T   T   T
-equemene
+.4999658150793101  0.4999168754294835  0.2974680428614041   T   T   T
-equemene
+.1665405010219072  0.3330823961827170  0.3974964450182662   T   T   T
-equemene
+.6665975225309845  0.3330642960797304  0.3975177029878819   T   T   T
-equemene
+.1665996677662783  0.8330538544691352  0.3975167863229472   T   T   T
-equemene
+.6665572450291234  0.8331019445865336  0.3974969275775631   T   T   T
-equemene
+.5929747344527317  0.4140358994090573  0.5812350180389987   T   T   T
-equemene
+.6943114107032239  0.2794239342435746  0.5915072062646071   T   T   T
-equemene
+.4917024505660316  0.5487034897377517  0.5709635073040794   T   T   T