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OpenPath: OpenPath is dead, Long live Opt'n Path
The OpenPath project has been renamed into Opt'n Path.¶
Check it at:
[[http://perso.ens-lyon.fr/paul.fleurat-lessard/ReactionPath.html]]
Distonet: Ajout de l'usage de GlusterFS sur InfiniBand
GlusterFS a été évalué sur Distonet jusqu'à présent en Gigabit Ethernet et pour du stockage avec redondance (tolérance aux pannes exigée).
La version "stripe" associée à une interconnexion Infiniband est étudiée.
Distonet: Ouverture du projet comme public
A l'occasion de la présentation du projet aux JRES 2011, le projet est ouvert au public.
Le public intéressé y trouvera les documentations techniques (encore en cours de rédaction) permettant de réaliser les mêmes travaux que ceux déjà réalisés dans le cadre de l'étude.
OpenPath: OpenPath Version 1.4
OpenPath 1.4 has been released.
Big changes:
- New methods for Hessian updates have been added. The following methods are now availables:
For inverse Hessian: BFGS, DFP, MS.
For Hessian: BFGS, DFP, MS, Bofill
- Some output files have been added to the examples directories. For the moment, only for the Prog='test' option....
Small changes:
- Added two flags: CalcEReac and CalcEProd. If .TRUE. Path will compute the energy of the reactant
(and/or Product) at the begining of the calculations. This is useful if you start from non optimized points.
- The "HesUpd" flag is replaced by "Hupdate"
- some code cleaning.
- Some utilities for the HCN toy system (in ~/examples/Test) have been improved.
It can be downloaded either with SVN or at http://forge.cbp.ens-lyon.fr/redmine/attachments/download/25/openpath_1.4.tgz
OpenPath: OpenPath Version 1.3
OpenPath 1.3 has been released. Small bugs have been fixed.
It can be downloaded either with SVN or at http://forge.cbp.ens-lyon.fr/redmine/attachments/download/10/openpath-1.3.tgz
OpenPath: Sortie de OpenPath en version 1
La version 1 de OpenPath est maintenant disponible en libre téléchargement.
Comme le mentionne la licence, le logiciel est distribué sous licence GNU/GPL ou CeCILL (http://www.cecill.info/licences.fr.html).
Tout utilisateur, par contre, s'engage tacitement à mentionner l'auteur (Paul Fleurat Lessard) dans le cadre d'une publication scientifique s'il a fait usage du présent logiciel.
Le logiciel est disponible sur le lien suivant : http://forge.cbp.ens-lyon.fr/redmine/attachments/download/4/openpath-1.0.tgz
HPL sur GPU: GotoBLAS en OpenSource
Le Texas Advanced Computing Center a placé GotoBLAS dans une licence BSD.
Il y a fort à parier que cette publication va rapidement entraîner son portage sur les différentes distributions GNU/Linux que nous utilisons, en complément d'une ATLAS déjà vieillissante.
HPL sur GPU: Support de CUDA le 26 novembre 2010
La librairie de Nvidia permettant d'exploiter le GPU, CUDA, dispose d'une implémentation de BLAS, CuBLAS.
Cette libraire apporte l'avantage de modifier à minima son programme pour le porter sur architecture GPU.
Il est alors possible, sur des fonctions très spécifiques, d'approcher la limite théorique de puissance des GPU : par exemple, les fonctions xGEMM (multiplication matrice matrice).
Sur xHPL, les performances ne deviennent significatives que sur des systèmes de grande taille (supérieurs à 4000).
Les avantages :- de modifier son code source de manière réduite pour le porter sur GPU.
- la transformation de fonctions BLAS en CuBLAS est largement simplifiée pour les fonction FBLAS, pas CBLAS
- les appels sont légèrement différents, ce qui impose l'usage de directives
- les performances ne sont significatives que sur les gros systèmes
- les performances ne sont intéressantes que pour certaines fonctions BLAS (xGEMM)
Formats disponibles : Atom